院长: 王思明 教授
院支部书记: 沈志忠 教授
副院长: 夏如兵 副教授
副院长: 何红中 副教授
研究生办主任: 夏如兵 副教授(兼)
副主任: 李昕升 博士
科研办主任: 刘馨秋 副教授
《中国农史》编辑部主任: 沈志忠 副主编(兼)
联合研究中心:
普渡大学-南京农业大学中国研究联合中心主任: 王思明 教授
Douglas Hurt教授
世界农业传播联合研究中心主任: 王思明 教授(南京农业大学)
Martin Bell教授(雷丁大学)
中日农史比较研究中心主任: 衣保中 教授(南京农业大学)
黑泷秀久 教授(东京农业大学)
省部研究基地:
江苏省高校哲学社会科学重点研究基地-中国农业历史研究中心主任: 王思明 教授
江苏省非物质文化遗产重点研究基地主任: 王思明 教授
院级研究中心:
作物史研究中心主任: 惠富平 教授
副主任: 何红中 副教授
畜牧兽医史研究中心主任: 李 群 教授
农史文献数字化研发中心主任: 包 平 教授
中国近现代农业史研究中心主任: 夏如兵 副教授
中国农业文化遗产保护研究中心主任: 李 明 副教授
副主任: 刘馨秋 副教授